¶ Introduction
Interface centrale de l'EDS, Arkhn Admin permet de :
- Créer les utilisateurs (liés à l'AD)
- Accéder à la documentation
- Accéder aux orchestrateurs
- Accéder aux différentes solutions Arkhn
- Extraire des jeux de données
- Créer des bulles sécurisées
- Gérer les demandes
¶ Connexion à Arkhn Admin
¶ Choisir un profil
Le référentiel EDS de la CNIL impose que les profils de connexion soient différenciés selon l'accès par l'utilisateur à des données identifiantes ou non.
Il faut donc déclarer quel est le profil utilisé en se connectant à Arkhn Admin.
Le profil « données identifiantes » permet la gestion des identités des patients opposés à la réutilisation de leurs données.
**Gestion des utilisateurs**
**Créer un nouvel utilisateur **
**Modifier les droits **
Outils accessibles depuis le Menu Principal
¶ Accéder aux autres Solutions d'exploitation des données
Autres solutions pour l'exploitation des données, accessibles depuis la page d'accueil
- Superset (outil de BI)
- Arkhn Explore (pré-screening et création de cohortes)
Création et gestion des bulles sécurisées
Jeux de données
¶ Extraction de données relative aux patients d'une cohorte explore
Toutes les cohortes créées sur explore sont disponible dans l'EDS dans la table explore.cohort_definition et donc accessible pour une extraction sous la forme d'un jeu de données.
pour récupérer les données des patients d'une cohorte particulière, notez le cohort_definition_id de la cohorte concernée (82 pour la cohorte "My cohort 001" dans la capture d'écran au dessus) et vous retrouverez l'ensemble des patients de la cohorte dans la table explore.cohort
ces 2 tables suivent la modélisation OMOP definie ici, vous y retrouverez en particulier
cohort_definition_id: l'identifiant de la cohortesubject_id: le pseudonyme principal du patient dans l'EDS, utilisé pour relier le patient à ses differentes données de santésubject_pseudonym: un pseudonyme unique pour le patient dans cette cohorte (ajout par rapport à la norme OMOP)
Ces 2 tables sont aussi projetées dans le pivot sousdbt_pivot.pvt_cohort_definitionetdbt_pivot.dbt_cohortsi vous souhaitez lier ces cohortes avec les données médicales de patients, comme par exemple les visites
vous pouvez ensuite lier ce subject_id avec les données medicales du patient qui vous intéressent, par exemple les visites
Gestion des demandes
Gestion des patients Opposés
La récolte de l'opposition des patients se fait par le/la DPO de l'établissement. La plateforme Arkhn ne propose pas d'outil pour récolter l'opposition des patients.
Une fois que les patients ont manifesté leur opposition à la réutilisation des données, il est possible de renseigner dans l'EDS la liste des patients opposés (via leur IPP).
Les patients opposés pourront être exclus des jeux de données créés pour les études / projets de recherche.
¶ Enregistrer dans l'EDS l'opposition d'un patient ou d'une liste de patients :
(avec l'IPP du/des patients)
- Se connecter à Arkhn Admin avec le profil "Données Identifiantes"
- Dans le menu à gauche, sélectionner "Patients Opposés"
- En cliquant sur le bouton "Mettre à jour la liste", on peut soit rajouter manuellement un patient avec son IPP, soit charger une liste de patients à partir d'un csv
¶ Exclure les patients opposés d'une recherche
La table que recense tous les patients opposés est dans le datalake sous le nom regulatory.opt_out_patient - cette table peut être utilisée dans les requêtes en SQL pour exclure les patients opposés d'un dataset.
🆕 Ré-identifier un patient
L'objectif est de pouvoir re-contacter un patient si on en a besoin. Le référentiel EDS donne trois cas où cela est necessaire : pour soigner un patient, lui proposer de l'inclure ou non dns une recherche ou bien pour l'exercice de ses droits.
La ré-identification d'un patient se fait par les personnes habilités de l'établissement grâce :
- à son IPP
- à son pseudonyme principal (utilisé dans le pivot)
- à son pseudonyme lié à une cohorte Explore
Pour en savoir plus sur les différents pseudonymes vous pouvez vous référer à la page :
- Se connecter à Arkhn Admin avec le profil "Données Identifiantes"
- Dans le menu à gauche, sélectionner "Réidentifier un patient"
- Après avoir entré le pseudonyme (ipp ou pseudo), en cliquant sur le bouton "Rechercher", on peut voir les informations relatives à l'IPP du patient